反相色譜柱是氣液相的關鍵部件，主要由兩大類組成，毛細管柱和填充柱，其中毛細管柱由兩部分組成：管線和固定相，管線主要有熔融石英（管外涂漬了聚酰亞胺）和不銹鋼兩種。固定相是色譜分離的關鍵，它有很多種，大多數是高分子量、熱穩定性好的聚合物，這些聚合物是液體或膠，常用的是聚硅氧烷（有時錯誤的稱為硅橡膠）和聚乙二醇，還有另外常用的固定相是小的多孔顆粒，由聚合物和沸石（例如：氧化鋁和分子篩）組成，在色譜實驗過程中選擇合適的反相色譜柱對實驗的順利開展和實驗結果的性而言是十分重要的。 反相色譜柱固定相的選擇
反相色譜柱固定相的選擇是關鍵，一般從以下幾個方面考慮：
1、氣相色譜中，兩種分析物由于其與固定相的相互作用不同而發生分離，因此必須選擇一個與樣品特性相匹配的固定相；
2、如果不知道使用何種固定相，可以從非極性和弱極性柱開始使用，如果效果不好，再按極性漸強的順序選用中等極性直到性柱逐一嘗試，直到有較令人滿意的分析結果即可確定使用的柱極性；
3、低流失（“ms”）反相色譜柱通常更為惰性，有更高的溫度上限，適用于MS檢測器；
4、使用能夠提供滿意的分離度和分析時間的極性小的固定相，非極性固定相比極性固定相具有更長的使用壽命；
5、要使用和被分析物極性相近的固定相，使用這一選擇方法常常是有效的；
6、如果被分析物具有不同的偶極和氫鍵力，改變使用具有不同偶極或氫鍵力（不一定大）的固定相后，會出現新的其他共流出物，所以新的固定相不一定提供更好的總分離度；
7、如果可能，要避免使用含有能使選擇性檢測器產生高響應值功能團的固定相，例如含有氰丙基的固定相，用NPD會產生不同比例的增大基線高度（由于柱流失）；
8、PLOT柱用于在高于室溫的柱溫下來分析氣體樣品。
no.2反相色譜柱直徑的選擇
反相色譜柱直徑的選擇通常取決于儀器或檢查條件，大多數的現代化的氣相色譜設備都與大部分反相色譜柱的尺寸相兼容，內徑增大，反相色譜柱的樣品容量增，但分離度和靈敏度降低。反之，尺寸較小的反相色譜柱，其分離度和靈敏度也相應提高，但缺點是樣品容量減少，所需樣品量增多。的方法是找一個已有的色譜方法，并以此為基礎進行優化，不同的反相色譜柱直徑有不同的適用情況。
1、當需要有高柱效的反相色譜柱時應使用0.18-0.25mm的反相色譜柱，0.18mm的反相色譜柱很適用于泵容量低的GC/MS系統，小內徑柱的容量小而且需要的柱頭壓力；
2、當需要樣品容量大時要使用0.32mm內徑的反相色譜柱，與0.25mm的內徑柱相比，0.32mm的內徑柱對不分流進樣或大體積（>2微升）進樣時早流出的色譜峰有較高的分離度；
3、只有配備大口徑直接進樣口時，才使用0.53mm內徑的反相色譜柱它特別適用于高載氣流速的應用，例如吹掃捕集、頂空進樣，0.53mm內徑反相色譜柱在恒定的液膜情況下具有的樣品容量。
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